無(wú)土栽培對病蟲(chóng)防治，除選用抗病品種及種子消毒外，可培育壯苗，降低濕度，通風(fēng)換氣，采用生物藥劑和化學(xué)藥劑相結合的綜合防治技術(shù)措施，多種藥劑交替使用，效果顯著(zhù)，藥效較高。
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1、無(wú)土栽培對于根部以上的病蟲(chóng)害，一般是采用防蟲(chóng)網(wǎng)和陽(yáng)光板隔離、物理滅殺（黃板、藍板沾蟲(chóng)，燈光誘捕）、電功能水滅殺和生物誘殺等方法。
2、對于根部以下的病蟲(chóng)害一般是采用更換營(yíng)養液和紫外燈光滅殺的方式，設備、部件可用0.2%的高錳酸鉀溶液浸泡消毒。
3、無(wú)土栽培的基質(zhì)培，每種完兩茬、三茬后的處理方法：隔離，也就是建溫室，加防蟲(chóng)網(wǎng)，把病害蟲(chóng)害完完全全地隔離開(kāi)來(lái)；物理除蟲(chóng)，對于鉆進(jìn)溫室的蟲(chóng)子，利用蟲(chóng)子趨黃光、藍光的特性，在溫室內多處懸掛黃板、藍板，用不干膠粘蟲(chóng)子；用生物誘導，利用昆蟲(chóng)喜歡的氣味吸引害蟲(chóng)自投羅網(wǎng)，或被高壓電死或被淹死；采用電功能水（一種較強酸性卻絕對無(wú)毒的水）殺蟲(chóng)滅菌；采用蟲(chóng)子不吃的轉基因品種。以上這些方法都不存在任何毒性殘留，除了第五種方式以外，前面四種是有機農業(yè)、綠色農業(yè)防治病蟲(chóng)害的標準配置方式。
4、水培和氣霧培，在實(shí)際操作中流動(dòng)的營(yíng)養液都是要經(jīng)過(guò)滅菌殺毒裝置的。
5、自家陽(yáng)臺水培，靜止水培用完一茬剩下的殘液含營(yíng)養成分很淡了，就全部用來(lái)澆花澆菜了。管道無(wú)土水培在換茬以后可以在營(yíng)養液儲存槽內放置一盞紫外光殺菌燈達到消毒滅菌的作用，兩茬、三茬后，一般將管道和槽內的營(yíng)養液全部換出來(lái)，用來(lái)澆花澆菜即可。管道用高錳酸鉀溶液浸泡消毒。