技術(shù)要求高，普遍推廣較困難
因作物不同品種和不同生長(cháng)階段對養分的需求不同，導致?tīng)I養液的配置與管理需要有接受過(guò)技術(shù)培訓的專(zhuān)業(yè)人員完成，不能廣泛地被一般的勞動(dòng)者所掌握．營(yíng)養液配置時(shí)所用的專(zhuān)用化肥，市場(chǎng)上不易買(mǎi)到，并且價(jià)格高昂，這也成為了無(wú)土栽培技術(shù)沒(méi)有被廣大勞動(dòng)者掌握的原因之一。
廢棄液存在污染環(huán)境的風(fēng)險
無(wú)土栽培離不了營(yíng)養液，與營(yíng)養液配制相配套需一系列設備，如，測試系統、循環(huán)泵等，并且如果是開(kāi)放式栽培技術(shù)，存在廢棄營(yíng)養液硝酸鹽含量高，排放后易引起水體富營(yíng)養化的危險；如果是封閉式栽培技術(shù)，營(yíng)養液中大量有機質(zhì)的存在易滋生病原菌，給作物帶來(lái)毀滅性破壞的風(fēng)險。
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系統設備投資成本高
各種應用營(yíng)養液來(lái)灌溉作物的無(wú)土栽培系統，一般每667㎡地一次性投資至少6000元以上，有的甚至高達５～６萬(wàn)元，即使較實(shí)用的有機生態(tài)型無(wú)土栽培系統，其一次性投資也達2000～3000元。為從長(cháng)遠看，通過(guò)引進(jìn)國外設備和技術(shù)進(jìn)行本土化改良，研究和開(kāi)發(fā)適合我國國情的無(wú)土栽培系統是發(fā)展的關(guān)鍵。
政府的扶持力度不夠
目前國內出臺了很多惠民政策，其中就包括農機具補貼，但大多數省份就只有設施大棚有補貼，而實(shí)現無(wú)土栽培自動(dòng)化及智能化所需要的智能溫室并不在扶持范圍內。
每個(gè)新興技術(shù)在應用的過(guò)程或多或少都會(huì )存在這樣或那樣的問(wèn)題，無(wú)土栽培技術(shù)就是一個(gè)非常鮮明的案例，但這項有利于可持續設施園藝發(fā)展的技術(shù)還是值得從業(yè)者去探索的，洞悉這項技術(shù)的每一個(gè)細節。